ダークエッグマン
【だーくえっぐまん】
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コメント
おなまえ（省略可）
↓×2：ダークエッグマンを呼び出すと勝手にたまごが壊れるのはボス将軍限定。通常の将軍相手ではきちんと倒すこと。ついでに退却連発からこの展開になった場合、直後の激突で大概死ぬので、操作の違うスマホ版ではリスクが跳ね上がっている。
まねっこエッグで返すと普通のエッグマンが章問わず出る。
こちらはエッグマンを何度でも呼べるが、敵側はこれを1度召喚すると次の戦闘からは自動的にたまごが壊れる。囮役に高ランクの切り札を所持して何度も突貫しつつ相手のたまごを浪費させる作戦の場合、囮役の将軍はダークエッグマンを倒す必要はない。
ボス将軍といえど、たまごの使用回数が0になると、こいつしか呼べなくなる。ここがボス将軍の最大の弱点のひとつ。
エッグマンと台詞は同じ。ダークエッグマンの前にゾンビを出すと、手軽にエッグマンの勝ち台詞を見る事が出来ます。
（急行デューン号）
タイトーの「ソーシャルネットワーキングサービス“しまにてぃ”」にて、2006年7月14日〜8月31日までこの作品とのコラボレーションが行われる。その作品内で、なんと最強の怪獣役を務めている。
（wani!）
使用技【エッグチョップ】【エッグキック】
しかし元がエッグマンなために弱い……
（Kenzi）
半熟２：完熟軍に呼び出される事で姿を現す、漆黒のエッグマン。エッグマンに匹敵する実力を誇り、エッグマンと同じ技を繰り出して半熟軍の前に立ち塞がる。